Type d’offre : Stage
Localisation : Poitiers, Vienne
Recruteur : Université de Poitiers
Niveau : Master 2
Limite de candidature : 01/12/2026
Sujet du stage :
Modèles de dynamiques de populations d’Alouette des champs et de Bruant proyer sur la Zone Atelier Plaine et Val de Sèvre
Collaboration Université de Poitiers & CEBC Chizé
Le contexte
Ce stage s’inscrit dans le cadre du projet EDyPE (Étude des Dynamiques de Population pour la Transition Écologique) de la Région Nouvelle-Aquitaine.
L’objectif du projet EDyPE est de développer de nouveaux modèles de dynamiques de populations pour prédire, pour différents scénarios agricoles, le meilleur compromis entre production agricole et conservation de la biodiversité. Les modèles considérés sont basés sur des équations aux dérivées partielles (EDP) à paramètres variables capables de représenter les dynamiques spatiales et temporelles des populations et l’hétérogénéité environnementale.
L’approche identification de systèmes et ses développements récents permettent d’envisager la calibration de ces modèles EDP à partir de données naturalistes et environnementales.
Une pré-étude est nécessaire pour construire la variable qui caractérise l’hétérogénéité environnementale sur la base des principaux impacts agissant sur les populations étudiées. C’est l’objet de ce stage qui se concentrera sur deux espèces d’oiseaux : l’Alouette des champs et le Bruant proyer. La zone d’étude est limitée à la Zone Ateliers Plaine et Val de Sèvre.
Le sujet
L’objectif principal du stage est de calibrer des modèles de dynamiques de populations de type GLM (generalized linear model) capables d’expliquer l’évolution de l’abondance des deux espèces étudiées.
Les travaux débuteront par une mise en forme de diverses variables explicatives : éléments naturels (haies, bandes enherbées, arbres isolés), assolements (prairies, cultures, forêt, bâti…), pratiques agricoles (taille des parcelles, irrigation, agriculture biologique…), données bioclimatiques pour citer les principales.
Ensuite, pour certaines variables, il sera nécessaire de définir les distances d’effet via le package R « Siland: Spatial Influence of Landscape« .
Enfin, les modèles GLM, calibrés à partir des données d’observation et des principales variables explicatives, permettront de définir une variable représentant la qualité de l’habitat dans l’espace et dans le temps, variable image de l’hétérogénéité environnementale nécessaire au projet EDyPE.
Cette variable d’hétérogénéité environnementale sera intégrée aux modèles EDP développés par les chercheurs du LIAS. L’objectif à plus long terme serait de simuler différents scénarios pour l’aide à la décision en termes de politique publique. Ces dernières activités ne relèvent pas du stage.
Lieu et environnement du stage
Le lieu de stage est l’Université de Poitiers. Le ou la stagiaire partagera son temps entre le laboratoire d’Écologie et Biologie des Interactions (EBI), lieu de stage principal, et le Laboratoire d’Informatique et d’Automatique pour les Systèmes (LIAS).
Il ou elle se rendra autant que de besoin au Centre d’Études Biologiques de Chizé (CEBC Chizé – Deux-Sèvres). Les frais de mission seront pris en charge.
Profil recherché
Étudiant(e) de Master 2 en Écologie ou en Biostatistique.
Le ou la stagiaire doit disposer des qualités suivantes :
- Compétences en gestion des données (analyses statistiques et SIG) ;
- Compétences en programmation sur le logiciel R ;
- Un bon niveau en français et en anglais est fondamental.
Conditions du stage
Encadrement :
Régis Ouvrard, encadrant principal (LIAS, Université de Poitiers)
Vincent Bretagnolle (CEBC Chizé – CNRS, Université de La Rochelle) & Nicolas Deguines (EBI – CNRS,
Université de Poitiers)
Employeur : Université de Poitiers
Indemnités de stage : Environ 625€ par mois
Candidatures
Date limite de candidature : 1er décembre 2026
Référence de cette offre de stage en écologie dans la Vienne : OE-241026-1
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