Close Menu
Orientation Environnement
  • Accueil
  • Agriculture forêt
  • Biodiversité
  • Eau
  • Énergie
  • Déchets
  • DD QSE RSE
  • RECRUTEURS
  • EMPLOI
  • STAGES
  • ALTERNANCE
  • VOLONTARIAT
MÉTIERS
FORMATIONS
AGENDA
LinkedIn
Orientation EnvironnementOrientation Environnement
Carrières Orientation Environnement
  • Accueil
  • Services
    • Publier une offre
    • Référencer une formation
    • Annoncer un événement
  • Agriculture Forêt
    1. Emplois & Stages
    2. Formations
    3. Métiers
    4. Agenda
    métiers du paysage et horticulture
    Guide des métiers des jardins et du paysage
    métiers du paysage et horticulture
    Guide des métiers des jardins et du paysage
    FDIDS 57
    Technicien estimateur de dégâts de sangliers H/F
    association arbre & agriculture
    Service civique agroécologie et agroforesterie H/F
  • Écologie
    1. Emplois & Stages
    2. Formations
    3. Métiers
    4. Agenda
    CCDSP Drôme Provence
    Chargé de mission Environnement à Pierrelatte H/F
    CCDSP Drôme Provence
    Chargé de mission Environnement à Pierrelatte H/F
    recrutement réserves naturelles catalanes
    Apprentissage inventaire des espèces de la réserve naturelle de Jujols H/F
    Association Planète Mer à Marseille
    Chargé de mission Pêche H/F
  • Eau
    1. Emplois & Stages
    2. Formations
    3. Métiers
    4. Agenda
    Technicien spécialisé dans le traitement des eaux usées
    Les Licences professionnelles dans le domaine de l’eau
    Technicien spécialisé dans le traitement des eaux usées
    Les Licences professionnelles dans le domaine de l’eau
    seasy, syndicat d'assainissement des yvelines
    Adjoint technique Réseau AEP / VRD en alternance H/F
    exemple d'hydrosystèmes, les lacs
    Master HBV : hydrosystèmes et bassins versants
  • Énergie
    1. Emplois & Stages
    2. Formations
    3. Métiers
    4. Agenda
    technicien de maintenance éolien devant une éolienne
    Le métier de technicien maintenance éolien
    technicien de maintenance éolien devant une éolienne
    Le métier de technicien maintenance éolien
    alternance énergie et électricité
    Alternance Chargé d’affaires en électricité H/F
    UAPV 2025 autoconsommation
    Université de l’autoconsommation photovoltaïque 2025
  • Déchets
    1. Emplois & Stages
    2. Formations
    3. Métiers
    4. Agenda
    logo terre valserhone interco
    Chargé de prévention des déchets H/F
    logo terre valserhone interco
    Chargé de prévention des déchets H/F
    réseau recto verso
    Apprenti Écologie Industrielle et Territoriale H/F
    ORDIF, observatoire des déchets en Île-de-France
    Alternance Assistant d’enquête déchets du BTP H/F
  • Développement durable
    1. Emplois & Stages
    2. Formations
    3. Métiers
    4. Agenda
    Département de Saône-et-Loire (71)
    Éducateur à l’environnement spécialisé « École dehors » H/F
    Département de Saône-et-Loire (71)
    Éducateur à l’environnement spécialisé « École dehors » H/F
    formations Sup de V
    SUP de V : n°1 au classement HappyAtSchool BTS 2025
    recrutements mediaterre conseil
    Stage Assistant d’étude évaluations environnementales H/F
  • Ressources
    1. Économie verte
    2. Carrière & Marché
    3. Conseils d’Orientation
    4. Focus écoles
    5. Interviews métiers
    6. Livres d’orientation
    formations Sup de V
    SUP de V : n°1 au classement HappyAtSchool BTS 2025
    formations Sup de V
    SUP de V : n°1 au classement HappyAtSchool BTS 2025
    association Propolis à Lalouvesc (07)
    Centre de formation Propolis
    métiers verts pour l'environnement sans le bac
    Travailler dans l’environnement sans le bac, c’est possible !
  • Stages
  • Emploi
  • Formations
Orientation Environnement
LinkedIn
Accueil > Agriculture forêt > Recrutements Agri Forêt > Thèse en biogéochimie des sols agricoles H/F


Thèse en biogéochimie des sols agricoles H/F

Recrutements Agri Forêt Un commentaireMise à jour :13/06/2025
Email LinkedIn Twitter Facebook Bluesky

Thèse biogéochimie au Laboratoire ECODIV

laboratoire ECODIV à Rouen

Offre de thèse de doctorat 2025/2028 en biogéochimie :
Rôle de la rhizodéposition pour la dynamique de la matière organique du sol
Date limite de candidature : 13 juin 2025

Contexte

Dans un contexte de changement climatique et d’insécurité alimentaire croissants, l’augmentation de la teneur en matière organique dans les sols agricoles est un défi majeur. Ceci permet en effet à la fois de réduire la dépendance des agrosystèmes aux fertilisants minéraux et de séquestrer du carbone (C) dans les sols, compensant en partie l’émission de gaz à effet de serre tel que le CO2 et atténuant ainsi le réchauffement planétaire1.

L’enjeu essentiel pour les sols de grandes cultures est de les faire basculer d’un statut de déstockage à un statut de stockage en C. Deux leviers peuvent être utilisés pour réaliser cette inversion des trajectoires de séquestration du C :
→ (i) augmenter les apports directs de C organique frais au sol ;
→ (ii) favoriser la stabilisation du C organique dans le sol.
Le défi à relever est donc de développer des systèmes de culture capables de combiner ces leviers tout en maintenant une production économiquement viable2.

L’un des moyens pour favoriser le stockage de C dans les sols repose sur la rhizodéposition, c’est-à-dire l’apport de matière organique fraîche au sol par les plantes via leurs racines vivantes3. La rhizodéposition a ainsi été identifié comme une source majeure de formation de la matière organique du sol, notamment la fraction stabilisée par interaction avec les minéraux réactifs du sol3.
La sélection variétale des plantes de grandes cultures basée sur la capacité des variétés testées à approvisionner le sol en C frais via la rhizodéposition représente ainsi une voie prometteuse pour promouvoir le stockage de C organique dans les sols agricoles. Néanmoins, la rhizodéposition peut également promouvoir la minéralisation du carbone organique du sol, en déstabilisant les association organo-minérales4 ou par stimulation des décomposeurs5. L’effet global sur le bilan net de gain/perte de carbone organique dans les sols reste encore mal connu6.

Objectif de la thèse en biogéochimie

L’objectif de cette thèse de doctorat sera de tester l’effet de deux variétés de sorgho contrastées en termes de flux de rhizodéposition sur la dynamique de la matière organique dans un aérosol. Elle sera composée de trois études complémentaires :

  1. Une étude ex situ basée sur un marquage 13C de plants de sorgho réalisée au laboratoire BIAM suivie d’incubations en conditions contrôlées au laboratoire ECODIV permettant de mesurer l’effet des racines vivantes sur les processus de minéralisation du C et de l’azote issus de la matière organique du sol via le phénomène de ‘rhizosphere priming effect’6–8.
  2. Une étude terrain réalisée au CEREEP – ECOTRON IDF basée sur une méthode de substitution C3-C49 couplé à des mesures isotopiques 13C/14C10 qui visera à déterminer la formation de C nouveau issu du sorgho, la quantité et l’âge du C natif minéralisé, ainsi que le bilan net des gains/pertes de C du sol à l’échelle de la saison de végétation. L’effet des variétés de sorgho à la rhizodéposition contrastée sera testé en interaction avec l’ajout de minéraux réactifs pouvant favoriser le stockage de C dans le sol.
  3. Une étude prospective basée sur une modélisation numérique de la dynamique du carbone organique du sol via le modèle AMG11,12. Les données de l’étude terrain seront utilisées pour prédire sur plusieurs décennies le stockage du carbone du sol induit par la culture du sorgho en fonction de différentes trajectoires climatiques.

Profil du candidat

Le ou la candidat(e) devra être titulaire d’un Master 2 recherche avec une expérience significative dans un laboratoire de recherche.
Il (elle) devra posséder de bonnes bases théoriques dans une ou plusieurs des spécialités suivantes : biogéochimie, science des sols/pédologie, écologie fonctionnelle.
Il (elle) devra maitriser des outils statistiques sous R et d’excellente capacité rédactionnelle et orale en anglais.
Des compétences en termes de modélisation numérique et une aptitude au travail de laboratoire et de terrain seront aussi appréciées.

Aspects pratiques

Période : 3 ans sur la période Octobre 2025/Octobre 2028
Lieu: Laboratoire ECODIV, Bâtiment Blondel, place Emile Blondel, UFR Sciences et Techniques, Université de Rouen Normandie F-76821 Mont-Saint-Aignan Cedex, France
Financement : Le fonctionnement et le salaire de la thèse seront assurés par le projet RhizoSeqC (ANR PEPR FairCarbon – AAP 2024)

Candidature

Référence de cette offre de thèse en biogéochimie des sols agricoles : OE-120525-1
Envoyer CV, lettre de motivation, relevés de notes de Master (ou équivalent) et coordonnées complètes de deux personnes référentes, par mail avant le 13 juin 2025.

Le laboratoire ECODIV propose également ce 2è sujet de thèse (limite de candidature : 11/06/2025) → Thèse en biogéochimie et écologie des sols forestiers H/F

Bibliographie
1. Paustian, K. et al. Climate-smart soils. Nature 532, 49–57 (2016).
2. Alamos, S. & Shih, P. M. How to engineer the unknown: Advancing a quantitative and predictive understanding of plant and soil biology to address climate change. PLOS Biol. 21, e3002190 (2023).
3. Villarino, S. H., Pinto, P., Jackson, R. B. & Piñeiro, G. Plant rhizodeposition: A key factor for soil organic matter formation in stable fractions. Sci. Adv. 7, eabd3176 (2021).
4. Keiluweit, M. et al. Mineral protection of soil carbon counteracted by root exudates. Nat. Clim Change 5, 588–595 (2015).
5. Cheng, W. X. & Kuzyakov, Y. Root effects on soil organic matter decomposition. in Roots and soil management: interactions between roots and the soil (eds. Zobel, R. W. & Wright, S. F.) 119–143 (American Society of Agronomy, Crop Science Society of America, Soil Science Society of America, Madison, USA, 2005).
6. Dijkstra, F. A., Zhu, B. & Cheng, W. Root effects on soil organic carbon: a double-edged sword. New Phytol. 230, 60–65 (2020).
7. Cheng, W. et al. Synthesis and modeling perspectives of rhizosphere priming. New Phytol. 201, 31–44 (2014).
8. Henneron, L., Kardol, P., Wardle, D. A., Cros, C. & Fontaine, S. Rhizosphere control of soil nitrogen cycling: a key component of plant economic strategies. New Phytol. 228, 1269–1282 (2020).
9. Balesdent, J. & Mariotti, A. Measurement of soil organic matter turnover using 13C natural abundance. in Mass spectrometry of soils. (eds. Boutton, T. W. & Yamasaki, S. I.) 83–111 (1996).
10. Ndour, P. M. S., Hatté, C., Achouak, W., Heulin, T. & Cournac, L. Rhizodeposition efficiency of pearl millet genotypes assessed on a short growing period by carbon isotopes (δ13C and F14C). SOIL 8, 49–57 (2022).
11. Clivot, H. et al. Modeling soil organic carbon evolution in long-term arable experiments with AMG model. Environ. Model. Softw. 118, 99–113 (2019).
12. Kanari, E. et al. A robust initialization method for accurate soil organic carbon simulations. Biogeosciences 19, 375–387 (2022).

→ Laboratoires de recherche, diffusez vos offres de thèse en environnement ici

🔗 Termes associés : 

Emplois agriculture forêt Recherche environnement Recrutements clos Recrutements Normandie Thèses - Postdoc environnement
Éditeur d'Orientation Environnement
  • Website
  • LinkedIn

Jérôme, formé à l'écologie et l'aménagement du territoire, est spécialisé en communication éditoriale, veille informationnelle et recrutements en environnement. Publier une offre | Référencer une formation | Signaler un correctif

Suggestions de lecture

recrutements mediaterre conseil

Stage Assistant d’étude évaluations environnementales H/F

FDIDS 57

Technicien estimateur de dégâts de sangliers H/F

association arbre & agriculture

Service civique agroécologie et agroforesterie H/F

Un commentaire

  1. Recherche Environnement on 12/05/2025 21h18

    Vous recherchez un laboratoire d’accueil pour un stage, une thèse
    → Consultez cette liste de laboratoires spécialisés en environnement

Diffuser une offre
Référencer une formation
Recrutements Agri Forêt
FDIDS 57

Technicien estimateur de dégâts de sangliers H/F

association arbre & agriculture

Service civique agroécologie et agroforesterie H/F

producteur de thé bio en Bretagne

Stage production de thé et légumes bio H/F

Centre de formation Propolis
association Propolis à Lalouvesc (07)
Formations Agri Forêt
raisin agronomie durable

BTSA agronomie et cultures durables (ACD)

métier d'ouvrier paysagiste

Le métier d’ouvrier paysagiste

formation maraichage bio

BPREA Maraîchage bio

Messages récents
  • Orientation Environnement dans L’économie verte en Nouvelle-Aquitaine
  • Drilhole dans Comment trouver son stage ou emploi en environnement ?
  • Orientation Environnement dans L’économie verte en Occitanie
SERVICES
  • A propos
  • Diffuser une offre
  • Référencer une formation
  • Annoncer un événement
  • Se référencer dans l’annuaire
  • Signaler un correctif
  • Plan du site
FORMATIONS
  • BTS Environnement
  • BUT Environnement
  • BACHELORS Environnement
  • LICENCES PRO Environnement
  • MASTERS Environnement
  • INGÉNIEURS Environnement
  • MBA DD RSE
  • MS Environnement
STAGES ENVIRONNEMENT
  • Stages écologie
  • Stages déchets
  • Stages agro forêt
  • Stages eau
  • Stages énergie
  • Stages EEDD
  • Stages Bilan Carbone
EMPLOI ENVIRONNEMENT
  • Emplois écologie
  • Emploi eau
  • Emploi déchets
  • Emploi énergies
  • Emplois agriculture forêt
  • Recrutements RSE
  • Recrutements QSE QHSE
Facebook X (Twitter) LinkedIn Bluesky
  • Entreprises
  • Collectivités
  • Associations
  • Établissements de formation
  • Laboratoires
  • Cabinets RH
© 2005-2025 Orientation Environnement - Emplois, stages et formations en environnement en France
A propos • Mentions légales • Données personnelles • CGU • CGV • Publicité • Citations

Saisissez votre recherche et appuyez sur Entrer. Appuyez sur Esc pour annuler.

emploi orientation environnement
Gérez votre confidentialité

Pour offrir les meilleures expériences, nous et nos partenaires utilisons des technologies telles que les cookies pour stocker et/ou accéder aux informations de l’appareil. Le consentement à ces technologies nous permettra, ainsi qu’à nos partenaires, de traiter des données personnelles telles que le comportement de navigation ou des ID uniques sur ce site et afficher des publicités (non-) personnalisées. Ne pas consentir ou retirer son consentement peut nuire à certaines fonctionnalités et fonctions.

Cliquez ci-dessous pour accepter ce qui précède ou faites des choix détaillés. Vos choix seront appliqués uniquement à ce site. Vous pouvez modifier vos réglages à tout moment, y compris le retrait de votre consentement, en utilisant les boutons de la politique de cookies, ou en cliquant sur l’onglet de gestion du consentement en bas de l’écran.

Functional Toujours activé
The technical storage or access is strictly necessary for the legitimate purpose of enabling the use of a specific service explicitly requested by the subscriber or user, or for the sole purpose of carrying out the transmission of a communication over an electronic communications network.
Preferences
The technical storage or access is necessary for the legitimate purpose of storing preferences that are not requested by the subscriber or user.
Statistiques
Le stockage ou l’accès technique qui est utilisé exclusivement à des fins statistiques. The technical storage or access that is used exclusively for anonymous statistical purposes. Without a subpoena, voluntary compliance on the part of your Internet Service Provider, or additional records from a third party, information stored or retrieved for this purpose alone cannot usually be used to identify you.
Marketing
The technical storage or access is required to create user profiles to send advertising, or to track the user on a website or across several websites for similar marketing purposes.
Statistiques

Marketing

Fonctionnalités
Toujours activé

Toujours activé
Gérer les options Gérer les services Gérer {vendor_count} fournisseurs En savoir plus sur ces finalités
Gérer les options
{title} {title} {title}