Stage Suivi du franchissement des ouvrages par les poissons holobiotiques en grandes rivières H/F

Type d’offre : Stage
Localisation : Chatou (78)
Recruteur : EDF R&D
Niveau : Master 2
Limite de candidature : 13/11/2026
Durée : 5 ou 6 mois

Objet du stage : Les poissons holobiotiques comme modèle de suivi des ouvrages en grandes rivières aménagées à partir d’une approche inter bassins et multi outils : patrons de franchissement et tendances d’évolution des effectifs comptabilisés

Contexte du stage

La fragmentation des hydrosystèmes par les barrages hydro-électriques et ouvrages de navigation constitue l’un les principaux facteurs d’altération de la continuité écologique à l’échelle internationale.

Sur certains cours d’eau à enjeux, les gestionnaires d’ouvrages hydrauliques sont soumis à des obligations de résultats concernant l’efficacité de la libre circulation des poissons migrateurs, en particulier pour les espèces anadromes dont les  populations sont aujourd’hui en déclin et font l’objet de plans de gestion nationaux. Ils doivent ainsi concilier les objectifs de restauration de la continuité écologique avec ceux liés à la production énergétique, au transport fluvial et à la gestion de la ressource en eau, dans un contexte marqué par l’augmentation des extrêmes hydro-climatiques.

Si les dispositifs de franchissement piscicole permettent de restaurer l’accès aux habitats essentiels, leur fonctionnalité et leur efficacité restent majoritairement évaluées à partir d’indicateurs agrégés, tels que la composition spécifique, les effectifs, les taux de passage ou les temps de franchissement. Ces approches prennent encore insuffisamment en compte la forte variabilité interindividuelle des comportements de migration et de franchissement. Or, les individus diffèrent par leur mobilité, leurs capacités de nage, leur propension à l’exploration ou à la prise de risque.

Dans ce contexte, les ouvrages complexes et leurs différentes voies de passage (e.g, passes à poissons, écluses de navigation) peuvent agir comme des filtres écologiques, sélectionnant certains profils biologiques et comportementaux. Cette sélection comportementale peut diminuer la diversité des stratégies individuelles, le potentiel adaptatif des populations face aux changements globaux et, à terme, la résilience des populations.
Sur le plan scientifique, le projet dans lequel ce stage est intégré vise à mieux comprendre les mécanismes de migration et de franchissement d’ouvrages complexes, en évaluant le rôle des traits individuels et des facteurs environnementaux dans la variabilité des comportements observés.

Face à la rareté des migrateurs anadromes dans les grands cours d’eau étudiés, les migrateurs holobiotiques, espèces effectuant leurs déplacements uniquement en eau douce, sont utilisés comme modèles pour ces travaux. Ce sujet de stage s’inscrit au lancement du projet et permettra d’acquérir de nouvelles connaissances sur les patrons de déplacement des espèces holobiotiques (barbeau et brème notamment).
A partir de données de comptage, il s’agira principalement

1. de caractériser les patrons temporels de leur migration,
2. et d’étudier la tendance d’évolution des effectifs comptabilisés sur différents bassins versants.

Par la suite, sous réserve de l’obtention de financements, un projet de thèse est envisagé dès l’automne 2027 au sein de l’équipe de recherche EDF R&D – INRAE (Hynes) en collaboration  avec INRAE Lyon, l’université de Liège (Belgique) et HEPIA (Suisse).

Objectifs du stage

Dans un premier temps, il s’agira de prendre en main et participer à la mise à jour de bases de données compilant (a) les données de vidéo-comptage de poissons holobiotiques sur une vingtaine d’ouvrages de franchissement répartis sur 5 grands bassins versants français et suisses ; des données de piégeage dans des passes à poissons en Belgique et (c) des données comportementales acquises par télémétrie radio, RFID et acoustique en France,
Belgique et Suisse.

Ces données seront ensuite analysées pour :

1. Mettre en lumière les patrons temporels de fréquentation des passes à poissons (annuel, saisonnier, quotidien, horaire) par les espèces holobiotiques et réaliser des comparaisons inter-bassins ;
2. Évaluer les tendances d’évolution des effectifs de poissons holobiotiques comptabilisés. Ce volet intégrera une comparaison avec les tendances observées sur des données de pêches électriques acquises à proximité des ouvrages (base de données ASPE) ;
3. En fonction du temps disponible, les données de télémétrie pourront être mobilisées pour faire un bilan de la franchissabilité des grands ouvrages et estimer des taux de transfert entre ouvrages.

Étudiant(s) concerné(e)s

3e année d’école d’ingénieur ou Master 2.
De bonnes compétences en analyse de données, particulièrement sous R, sont requises (exploration, analyses multivariées, modèles linéaires généralisés).
Des compétences en gestion de base de données (SQL) seraient également appréciables.
Des connaissances en écologie, en particulier sur les écosystèmes aquatiques d’eaux douces, sont attendues.
Le stagiaire devra être autonome, avoir une réelle capacité de synthèse et un esprit critique.
De bonnes qualités rédactionnelles sont également attendues.

Conditions du stage

Lieu : EDF R&D LNHE
6 quai Watier 78400 Chatou
Durée : 5 ou 6 mois avec démarrage au premier trimestre 2027
Le stage est rémunéré en fonction du niveau d’étude du stagiaire.
Le site de Chatou dispose d’une cantine d’entreprise.

Contacts et candidature

Date limite de candidature : 13/11/2026
Référence de cette offre de stage en écologie : OE-131026-1
Envoyer CV et lettre de motivation par mail en cliquant ci-dessous à Romain ROY, Mikel CHERBERO et Céline LE-PICHON.

Références

• Alp, M.; Arnaud, F.; Barthélémy, C.; Bernez, I.; Clemens, A.; Cottet, M.; Dufour, S.; Germaine, M.-A.; Gramaglia, C.; Grivel, S.; Le Pichon, C.; Lespez, L.; Lusson, M.; Navratil, O.; Piégay, H.; Prunier, J.G.; Rollet, A.-J.; Tales, E.; Lamouroux, N., 2024.
  Restaurer la continuité écologique des cours d’eau: que sait-on et comment passer collectivement à l’action ? VertigO-la revue électronique en sciences de l’environnement.
• Castanheira, M.F.; Cerqueira, M.; Millot, S.; Gonçalves, R.A.; Oliveira, C.C.; Conceição, L.E.; Martins, C.I., 2016. Are personality traits consistent in fish ?—The influence of social context. Appl Anim Behav Sci. 178, 96-101.
• Lucas, M.C.; Baras, E., 2001. Migration of freshwater fishes. Oxford: Blackwell Science Ltd.
• Noonan, M.J.; Grant, J.W.; Jackson, C.D., 2012. A quantitative assessment of fishpassage efficiency. Fish Fish. 13, 450-464.
• Podgorniak, T.; Blanchet, S.; De Oliveira, E.; Daverat, F.; Pierron, F., 2016. To boldly climb: behavioural and cognitive differences in migrating European glass eels. Royal Society Open Science. 3, 150665.
• Silva, A.T.; Lucas, M.C.; Castro-Santos, T.; Katopodis, C.; Baumgartner, L.J.; Thiem, J.D.; Aarestrup, K.; Pompeu, P.S.; O’Brien, G.C.; Braun, D.C.; Burnett, N.J.; Zhu, D.Z.; Fjeldstad, H.-P.; Forseth, T.; Rajaratnam, N.; Williams, J.G.; Cooke, S.J., 2018. The future of fish passage science, engineering, and practice. Fish Fish. 19, 340-362.
• Tétard, S.; Maire, A.; Ovidio, M.; Benitez, J.-P.; Schaeffer, F.; Coll, M.; Roy, R., 2025. Multi-year movements of potamodromous cyprinid species within a highly anthropized river assessed using RFID-equipped fishways. Limnologica. 112, 126236.

Formations en écologie aquatique

Vous souhaitez vous former à l’étude des poissons, au fonctionnement des écosystèmes aquatiques et à la gestion des cours d’eau ? Découvrez ces masters en lien avec les thématiques de ce stage :

• Master FREMAC – Fonctionnement et restauration des écosystèmes aquatiques continentaux, Université Clermont Auvgerne
• Master GEMAREC – Gestion des milieux aquatiques et restauration écologique, Université de Lorraine
• Master AQUADURA – Gestion durable des milieux aquatiques, Université de Montpellier